Durante la Guerra Civil, también la Hemeroteca Municipal de Madrid quedó dividida en dos. Una sede se encontraba en Salamanca dependiente de la Delegación del Estado para Prensa y Propaganda del bando Nacional, a cargo de Antonio Asenjo, director y fundador de la institución. La otra en Madrid, en territorio republicano, bajo la responsabilidad de Manuel Rosón.
Esta circunstancia ha posibilitado que la Hemeroteca conserve la más completa colección de prensa de los dos bandos, herramienta fundamental para el conocimiento de la Guerra Civil española.